При дефиците фолиевой кислоты возможны гастриты и энтериты, конъюнктивиты, медленное заживление кожных ран. Вследствие лейкопении возникает иммунная недостаточность и активизируются хронические инфекции.
Нехватка витамина у беременных женщин чревата врожденными пороками центральной нервной системы у плода, задержкой психического и физического развития в первые годы жизни младенца. Гиповитаминоз В9 нередко становится причиной самопроизвольного прерывания беременности на ранних сроках.